Преподобный Арсений родился около 1840 года в каппадокийском селе Фараса, в Малой Азии; в крещении его назвали Феодором. Рано оставшись сиротой, он жил у тётки, потом учился в Смирне, а после поступил в монастырь Иоанна Предтечи в Кесарии. Учителей в те годы не хватало, и митрополит Паисий, рукоположив его во диакона, отправил обратно в родное село — учить детей.

Школы в деревне не было. Молодой инок расстелил овечьи шкуры прямо в жилой комнате — на них ученики и сидели. Это было ещё и предосторожностью: турецкие власти были против образования христиан на греческом языке, и случайный гость, заглянув, увидел бы просто людей на коленях, будто на молитве. Иногда занятия он проводил тайно в маленьком храме на скалах. В 1870 году в Кесарии Арсений принял священство и отправился в Иерусалим; после паломничества односельчане стали звать его Хаджиефенди. Он перевёл на местный диалект множество евангельских отрывков, и зимними вечерами мужчины села собирались у костра послушать притчи и жития, чтобы потом пересказать их дома.

Жил он крайне просто: комната с земляным полом, несколько покрывал вместо постели, овечья шкура перед иконами, несколько богослужебных книг — и всё. По средам и пятницам не выходил из кельи, молился и постился. О старой накидке из мешковины, которую его просили снять при приезде церковного начальства, он говорил, что это память о матери.

Вскоре молва понесла о нём слух как о чудотворце. К нему шли и христиане, и мусульмане; он никогда не спрашивал, какой человек веры, а лишь расспрашивал о болезни, чтобы прочитать нужную молитву. По свидетельству очевидцев, по его молитве выздоравливали глухие, слепые, парализованные и бесноватые. Будучи мягким человеком, он нарочно казался суровым с теми, кто хвалил его или предлагал плату, и требовал отдавать принесённое бедным. Константинопольский и Иерусалимский патриархи хотели сделать его епископом — он отказывался.

В 1924 году всё христианское население Фарасы вынуждено было переселиться в Грецию. Восьмидесятичетырёхлетний священник шёл к берегу вместе со своими людьми и отказался ехать на приготовленном для него ослике, уступив его ребёнку и больным. Он предсказывал, что умрёт вскоре после переезда, — так и вышло: преподобный скончался на острове Корфу ровно через сорок дней после прибытия. Позже его мощи увёз с Корфу старец Паисий Святогорец, которого он крестил в детстве; сегодня они покоятся близ Салоник, в монастыре Иоанна Богослова в Суроти. К прославлению в 1986 году привели многочисленные посмертные чудеса.