Преподобномученик Пахомий родился в Малороссии и в миру носил имя Прокопий. Ещё ребёнком он попал в плен и был продан в рабство в город Усаки — эти места в Анатолии называли также Филадельфией. В неволе он прожил семнадцать лет и всё это время терпеливо сносил обиды и поругания.

Получив свободу, Прокопий ушёл на Святую Гору Афон. Двенадцать лет он подвизался там под началом старца иеромонаха Иосифа, который и постриг его в монашество с именем Пахомий. Позже преподобный перешёл в Кавсокаливский скит и жил там под руководством старца Акакия.

Кончилась его жизнь там же, где началась неволя. Пахомий вернулся в Усаки и открыто исповедал себя христианином. Его схватили и требовали отречься от Христа; он отказался и был обезглавлен в Усаках 7 мая 1780 года — в день Вознесения Господня. Мощи преподобномученика покоятся на острове Патмос, в обители святого апостола Иоанна Богослова.

В святцах он значится как Пахомий Русский, Афонский; встречается и написание «Русин». Преподобномучеников принято писать на иконах в монашеском облачении, с крестом в правой руке.

Память преподобномученика Пахомия совершается 20 мая — 7 мая по старому стилю.