Священномученик Иоанн Восторгов родился 30 января 1864 года в станице Кавказской Кубанской области, в семье священника. Отец умер рано; сын вспоминал его как человека доброго и мягкого, которого любили прихожане. Детство и отрочество прошли в станице Ново-Александровской, в сиротстве и нужде, — и позже, вернувшись туда уже известным проповедником, он говорил с амвона, что именно здесь, среди простого верующего народа, в него были заложены первые и самые сильные чувства веры.

В 1887 году он окончил Ставропольскую духовную семинарию первым по разряду и был оставлен при духовном училище надзирателем, а затем учителем русского и церковнославянского языков. Тем же годом датируется его самое раннее сочинение — разбор старообрядческой австрийской иерархии с точки зрения церковных канонов. Преподавал он недолго: в августе 1889 года его рукоположили во диакона, а через несколько дней — во священника.

Первый его приход был трудным: большинство жителей составляли раскольники, и православного священника здесь не было около ста лет. Храм ему пришлось устраивать самому. За один год двадцатипятилетний батюшка добился многого: люди привыкли ходить в церковь, больше ста старообрядцев присоединились к Православию, на собственные деньги он открыл церковноприходскую школу и основал в селе общество трезвости.

Дальше была череда назначений: наблюдатель церковноприходских школ округа, законоучитель и настоятель гимназической церкви в Ставрополе, затем Елисаветполь, а с 1897 года — Тифлис. В Грузии он заведовал церковными школами в бедном, населённом сектантами районе; школ сначала было три, потом восемь, а число учеников за несколько месяцев дошло до пятисот, причём пятую часть составляли дети сектантов. «Пусть они сближаются с Церковью, пусть видят любовь к ним», — писал он. В 1900 году Синод поставил его наблюдателем церковных школ Грузинской епархии и возвёл в сан протоиерея.

В 1906 году начался московский период: отца Иоанна назначили синодальным проповедником-миссионером. Последние двенадцать лет жизни он отдал миссии. Он ездил по стране и за её пределы — по Сибири, Дальнему Востоку, Китаю, Корее и Японии, — осматривал школы и миссии, служил панихиды на могилах русских воинов. Увидев нужды переселенцев, он придумал и провёл в Москве пастырско-миссионерские курсы, готовившие священников и учителей для новых приходов: сто пять слушателей были рукоположены для Сибири и Дальнего Востока. Такие же курсы он заводил и на приходском уровне. В 1911 году по благословению Синода он ездил в итальянский Бари и купил там участок под русский храм и странноприимный дом для паломников, приезжающих к мощам святителя Николая. В 1913 году его назначили настоятелем Покровского собора на Рву в Москве — того, что все знают как храм Василия Блаженного.

Проповедником он был выдающимся, и это признавали все — от митрополитов до праведного Иоанна Кронштадтского, с которым он был близок. В 1916 году митрополит Макарий особым представлением предлагал Синоду поставить его епископом; предложение вызвало новую волну клеветнических выступлений против отца Иоанна.

Первые вести из Петрограда о начале Февральской революции отец Иоанн принял с тревогой: ему казалось, что камень уже сорвался с горы. 31 мая 1918 года его арестовали и заключили в московскую Бутырскую тюрьму, обвинив в попытке незаконно продать епархиальный миссионерский дом. На следствии он доказал, что обвинение — не просто клевета, а заранее подготовленная провокация. В начале июня он попросил разрешения послужить в тюремной церкви; заявление передали в ЧК, откуда 25 июня пришёл ответ: применить высшую меру наказания. 4 сентября дело постановили «ликвидировать во внесудебном порядке», и 5 сентября 1918 года протоиерея Иоанна Восторгова расстреляли на Ходынском поле в Москве.

Очевидцы рассказывали, что перед казнью он выпросил у палачей позволение всем осуждённым помолиться и проститься друг с другом, сказал им несколько слов о милости Божией и первым подошёл к яме.