В миру преподобномученика звали Флавиан Иванович Лаба. Родился он 3 июля 1863 года; родиной его было село Серебия в Гайсинском уезде Киевской губернии. О молодых годах его известно мало: он уехал на Афон, стал там монахом, а позже иеромонахом Свято-Пантелеимонова монастыря. В 1913 году его, судя по всему, вывезли со Святой Горы вместе с имябожниками.

После 1920 года отец Иоанн перебрался на хутор Солёный в Лабинском районе Армавирского округа на Кубани и жил там вместе с афонским монахом Иларионом (Цуриковым), приехавшим к нему из Москвы. Летом 1924 года обоих арестовали: им поставили в вину, что они «шли против советской власти и держались за старое». Приговор — три года ссылки в Нарымский край.

Освободившись, отец Иоанн снова поселился с отцом Иларионом — на этот раз в горах близ города Фрунзе, на пасеке. В феврале 1929 года последовал второй арест с тем же обвинением и тем же сроком. Отбыв и его, он поехал к своему духовному собрату, который к тому времени перебрался в город Мирзоян.

Все эти годы иеромонах жил в отдельной келье и регулярно совершал богослужения. К нему приходили престарелые монахини, среди них — сёстры отца Илариона, Магдалина и Гавриила. Такая тихая жизнь и была названа следствием «тайным монастырём». 24 июня 1937 года, на другой день после ареста отца Илариона, взяли и отца Иоанна: ему вменили участие в контрреволюционной организации, пораженческую агитацию и руководство этим «монастырём». Тройка при УНКВД по Южно-Казахстанской области приговорила его к высшей мере, и 4 сентября 1937 года он был расстрелян. К лику святых его причислили в 2000 году.

Преподобномучеников на иконах пишут в монашеском облачении, с крестом в руке — знаком мученической кончины; узнают образ по надписанию имени. К отцу Иоанну обращаются те, кому приходится хранить веру вдали от храма и от своих.