Священномученик Стефан, Степан Константинович Пономарев, был уроженцем города Верного, будущей Алма-Аты; появился он на свет 14 декабря 1880 года. Окончив в 1895 году церковно-приходскую школу, он в 1904-м стал псаломщиком в храме села Михайловского и учителем пения в приходской школе. Тогда же он женился на девице Прасковье; житие сохранило их разговор сразу после венчания: он спросил, хочет ли она быть с Господом, а услышав «хочу», сказал, что отныне он ей брат, а она ему сестра. С того дня они жили по-монашески.

Диаконскую хиротонию Степан Константинович принял в 1909 году, а вскоре после неё — и священническую. С 1914 по 1917 год он служил в полевом военном госпитале на фронте, много времени провёл в окопах, тяжело заболел и едва выжил. С тех пор его мучили головные боли — особенно зимой, в морозы, когда богослужебная утварь покрывалась инеем и голову приходилось закрывать шарфом.

Потом его направили в Николаевский храм в Верном и возвели в сан протоиерея. Служил он ежедневно и жил строго, как монах: тихо, неторопливо, благоговейно. «Боже упаси службу пропустить», — говорил он. Настоятелем того же храма был протоиерей Александр Скальский, живший одиноко, и отец Стефан уговорил его переселиться к ним; матушка Прасковья только обрадовалась. Так они и жили — две одинаковые тесные комнаты, стол, табурет и кровать, застеленная солдатским сукном.

В 1923 году Семиречье почти целиком захватило обновленчество. К 1927 году даже отец Александр стал колебаться и вслух говорил, что не знает, куда пристать. Отец Стефан держался твёрдо. Он сказал настоятелю, что сам в обновленчество не пойдёт и его никуда не отпустит: пусть выбирает себе придел и служит, ведь это его храм. Прихожанки плакали и умоляли настоятеля опомниться; одна старуха при всех пригрозила ему палкой — и он заплакал и ушёл в алтарь, а потом признался, что через эту старушку Господь просветил его разум. Отец Стефан ответил, что делом обновленчества тот не принял, но принял мыслью, и отстранил его от службы до покаяния. В ближайший праздник протоиерей Александр покаялся перед духовенством и паствой, и они снова стали служить вместе.

К 1929 году Николаевская церковь оставалась единственной православной в Алма-Ате; туда перешёл и не пожелавший остаться с обновленцами протоиерей Филипп Григорьев. 10 декабря 1932 года ОГПУ арестовало всех троих. В тюрьме они заболели сыпным тифом, и когда положение стало безнадёжным, их перевезли в тифозный барак. Там они и скончались один за другим: 17 января 1933 года — отец Филипп, 18-го — отец Стефан, 20-го — отец Александр. Похоронили их на кладбище, где в те годы хоронили сосланных в Алма-Ату крестьян.