Святитель Софроний, известный по фамилии Кристалевский, родился в 1703 году в Малороссии, в Черниговском полку. В миру его звали Стефаном — имя дали в честь первомученика архидиакона Стефана. Отец, Назарий Фёдоров, был человеком простого звания; в семье росли ещё два брата и сестра Пелагея. Детство прошло в местечке Березань Переяславского уезда, куда семья перебралась после отцовской отставки.

Получив духовное образование, юноша ушёл в Красногорский Преображенский монастырь, где уже подвизался его старший брат. Постриг с именем Софроний он принял 23 апреля 1730 года — в честь святителя Софрония, патриарха Иерусалимского. Житие рассказывает, что в ночь после пострига инок услышал в Покровском храме голос, повелевший ему, когда станет епископом, построить храм во имя Всех святых. Через два года его вызвали в Киев и рукоположили сначала во иеродиакона, потом во иеромонаха. Дальше были два года казначейства в родной обители и восемь лет службы экономом при переяславском архиерейском доме.

В январе 1742 года его в числе двадцати девяти иноков вызвали в петербургский Александро-Невский монастырь. Там он был сначала казначеем, а с 1746 года более семи лет — наместником. Себе в помощь он вызвал земляка, иеромонаха Синесия, и дружба этих двоих не прервалась до самой их кончины в Сибири. Слух о наместнике дошёл до императрицы Елизаветы Петровны, и по её указу от 23 февраля 1753 года Синод определил его на давно пустовавшую Иркутскую кафедру. Хиротония состоялась 18 апреля 1753 года, а до Иркутска новый епископ добрался лишь 20 марта 1754 года: почти год ушёл на дорогу и на подбор надёжных помощников.

Сибирское служение продлилось семнадцать лет. Владыка перестроил работу консистории, ставил настоятелями монастырей людей опытных и деятельных, требовал от духовенства уставного богослужения и сам объезжал дальние города — Нерчинск, Якутск, Киренск, месяцами не слезая с седла. Особой его заботой было образование: указом 1754 года он обязал духовенство учить своих детей, а монгольскую школу перевёл из Вознесенского монастыря в архиерейский дом, чтобы самому следить за преподаванием — и даже сам вёл уроки славянского и русского языка. Он рассылал благочинным подробные наставления о проповеди среди язычников: крестить желающих, учить их вере коротко и понятно, переводить молитвы на местный язык, не налагать непосильных постов, помогать неимущим. Заботился он и о быте коренных народов, предлагая им для поселения монастырские земли. При нём в Иркутске выросли каменный архиерейский дом и четыре храма, а в Богоявленском соборе появился Казанский придел — там его самого потом и похоронили.

Жил владыка сурово: келейник вспоминал, что пищу он употреблял самую простую и в малом количестве, большую часть ночи проводил в молитве, а спал на полу. Скончался святитель 30 марта 1771 года, на второй день Пасхи, после долгой тяжёлой болезни. Гроб простоял в соборе больше полугода, пока ожидали решения о погребении, — и тело осталось нетленным. Земле его предали 8 октября того же года. У гробницы начались исцеления; ещё до прославления записанных и проверенных чудес насчитали шестьдесят восемь. Мощи свидетельствовали в 1833, 1854, 1870 и 1909 годах. В 1917 году пожар в Богоявленском соборе уничтожил гробницу, но почитание от этого только выросло. Поместный Собор Русской Церкви постановил прославить святителя в 1918 году, и торжество совершилось 30 июня.

Святителей принято писать в архиерейском облачении, с благословляющей рукой и Евангелием. К святителю Софронию обращаются те, кому дорога сибирская церковная история, кто просит о помощи в учении и в трудном деле, начатом ради других.