Будущий священномученик родился 24 ноября 1878 года в Коломне и в крещении был назван Александром. Отец его, протоиерей Алексей Лебедев, служил в коломенском Успенском женском монастыре, мать Мария была дочерью священника. У него было четыре брата и три сестры. Мать рано умерла от воспаления лёгких, и воспитывал их отец: брал мальчика с собой в монастырь, где тот целыми днями оставался под присмотром монахинь и с радостью выстаивал долгие службы.

Учился он блестяще. Коломенское духовное училище, затем семинария, где ректор назначил его уставщиком и канонистом, — это надолго сроднило его с богослужением. В 1899 году он поступил в Казанскую духовную академию и окончил её в 1903-м по первому разряду. Дальше были четыре года преподавания гомилетики и литургики в Симбирской семинарии, а потом Москва: кадетский корпус, гимназия, Николаевский сиротский институт, преобразованный после революции в трудовую школу, которую он какое-то время возглавлял.

Призвание оказалось иным. Рождественским постом он принял монашеский постриг с именем Григорий в Зосимовой пустыни, потом перешёл в московский Данилов монастырь и прошёл там путь от иеродиакона до архимандрита. 2 декабря 1923 года патриарх Тихон рукоположил его во епископа и отправил в Петроград, сказав о нём: «Посылаю вам жемчужину». Владыка Григорий стал епископом Шлиссельбургским и наместником Александро-Невской лавры — в самые тяжёлые годы обновленческого раскола, которому он твёрдо не уступил.

Дважды его арестовывали ещё в двадцатые годы. Декларацию митрополита Сергия он не принял и ушёл на покой, а дальше жил тем, что писал и окормлял духовных детей письмами. Главный его труд этих лет — размышления над Евангелием от Марка. Ученикам он писал прямо: путь за Христом — это крест и непрерывный подвиг, и ждать от жизни покоя и довольства не стоит.

С 1933 года он поселился в тихом Кашине. Там его и арестовали 16 апреля 1937 года — обвинение звучало как руководство «фашистско-монархической организацией». На первом же допросе он всё отверг и виновным себя не признал. Его допрашивали трижды в апреле и мае; он не назвал ни одного имени, а ответы строил так, что зацепиться следствию было не за что. Убедившись в его твёрдости, следователи вызывать его перестали.

13 сентября 1937 года тройка приговорила его к расстрелу вместе с полусотней других людей. Через четыре дня приговор был приведён в исполнение.

Новомучеников-архиереев принято писать в архиерейском облачении, с Евангелием или благословляющей рукой; узнают образ по надписанию имени. Молятся владыке Григорию о крепости веры, когда за неё приходится платить, и о тех, кого судят по ложному обвинению.