О происхождении преподобного Ферапонта Монзенского и о его ранних годах сведений не сохранилось. Известно, что подвиг свой он начал в Москве и, вероятно, юродствовал, подражая блаженному Василию Московскому. Потом он перешёл в костромской Воздвиженский монастырь, принял там постриг и прожил тринадцать лет. Чудеса начались ещё при его жизни.

Однажды преподобный явился во сне сразу двум инокам Павло-Обнорского монастыря — Пафнутию и Андриану — и велел им основать обитель на берегу реки Монзы, близ Солигалича. Сам он, избегая людской славы, ушёл из Воздвиженского монастыря и какое-то время жил отшельником. Когда старец Андриан монастырь построил, преподобный прославил новую обитель двумя чудесами: он явился во сне двум отцам — рыбаку из Солигалича и кузнецу из города Буя, чьи сыновья были больны, — и предсказал, что дети получат исцеление в новом Благовещенском монастыре на Монзе. Мальчиков привезли туда, и оба выздоровели.

Через некоторое время преподобный сам пришёл в Благовещенскую обитель и попросил игумена, старца Андриана, стать его духовным отцом. На исповеди Андриан был потрясён чистотой его души и силой веры. Два года, прожитые Ферапонтом в Монзенском монастыре, были временем великого смирения, кротости и строгих подвигов. Обитель эта всегда оставалась ему дорога: он помогал её устроению и переносу на новое место, защищал от недоброжелателей, чудесным образом находил для неё средства.

День кончины преподобный предузнал, простился с братией и мирно почил 12 декабря 1597 года. Перед смертью он просил, чтобы ему, уже умершему, дали богоявленской воды; волю его исполнили, и он проглотил её. В монастырской летописи описаны многие исцеления у его гроба. Однажды святой спас суда, шедшие через пороги на реке Костроме прямо напротив монастыря: люди видели благолепного старца, который садился на корму каждого струга и правил в опасном месте. А ещё, явившись во сне игумену, он предсказал голод 1601 года и велел заранее запасти хлеба. Через двадцать лет после кончины его мощи были обретены нетленными — целыми оказались даже ризы.

Преподобных на иконах принято писать в монашеском облачении, со свитком в руке; северных подвижников часто изображают на фоне реки и деревянной обители. Молятся преподобному Ферапонту о выздоровлении близких — прежде всего о детях, с чего и началась слава его монастыря.