Стефан Фёдорович Грачев появился на свет 30 декабря 1886 года в крестьянской семье, в деревне Тростная Севского уезда Орловской губернии; детей у родителей было восемь. Отец с четырнадцати лет помогал в алтаре, а после и до конца жизни служил ктитором храма Архистратига Михаила в соседнем селе. Посты семья проводила на службах в Богородицкой Площанской пустыни — до неё было пять вёрст. Троих детей родители отдали в монастыри; Стефан попал в Площанскую пустынь десятилетним, а в 1904 году был зачислен в братию послушником.

В 1914 году его призвали в армию. Он воевал под Вильно и Гродно, получил младший офицерский чин и два Георгиевских креста. После демобилизации в 1918 году вернулся в родную обитель и жил там до её закрытия в 1921 году. Монашеских обетов послушник не даёт, и через некоторое время Стефан женился.

С 1924 года он служил псаломщиком, в 1929-м был рукоположён во диакона, а в марте 1930 года — во иерея. Вскоре его перевели в село Холмецкий Хутор Брасовского района, в старинный храм конца XVIII века; в приходе особо чтили подаренную когда-то помещиком Тихвинскую икону Божией Матери и ходили с ней крестным ходом по окрестным сёлам. Приход был большой — несколько деревень, на Пасху народ не помещался даже в ограде.

Родные вспоминали его как человека строгого и немногословного, который никогда не ругал детей. Прислуги он не держал: сам косил траву, рубил дрова, умел пилить, строгать, вырезать ложки. Хорошо знал ноты, перекладывал на них церковные песнопения, а разучивая их с детьми, брал скрипку и проигрывал мотив. Жила семья в приходской сторожке; после того как забрали корову, стало совсем бедно, но матушка по слову мужа кормила всех нищих, никому не отказывая. Церковное начальство отмечало его наградами — набедренником в 1932 году и камилавкой к Пасхе 1935 года.

Осенью 1935 года его вызвали в правление колхоза и потребовали подписку о том, что он отвечает за спокойствие прихожан при снятии колоколов. Отец Стефан ответил, что скорее даст себя арестовать, чем станет уговаривать людей отдать колокола. Замок на храме сломали, колокола вывезли. В засушливое лето 1936 года он пробовал добиться разрешения на молебен в поле — сельсовет сначала согласился, а назавтра запретил.

В августе 1936 года священника арестовали и три месяца допрашивали в брянской тюрьме, а потом отпустили за недоказанностью. Родные звали его бросить приход и переехать к брату в город, но он отказался, повторив, что понесёт свой крест до самого конца. 5 сентября 1937 года за ним пришли ночью. Из дома забрали всё, семью выселили из сторожки, храм закрыли окончательно. Обвинение отец Стефан отрицал. Особая тройка приговорила его к расстрелу, и 7 февраля 1938 года он принял мученическую кончину в Брянске. Реабилитировали его в 1989 году, а в 2006-м Священный Синод причислил к лику святых и включил в Собор новомучеников и исповедников Российских.