Будущий священномученик появился на свет 17 мая 1892 года в Деревягине — деревне Сапожковского уезда тогдашней Рязанской губернии. Отец его, Иоанн Кочуров, был священником. В 1913 году Сергей окончил Рязанскую духовную семинарию, через два года женился на Клавдии, дочери священника Петра Соловьева, и тогда же принял сан диакона, а вскоре и священника.

Служил отец Сергий в храме села Ухолово. В 1929 году власти начислили ему налог, который он не мог заплатить, а за неуплату забрали имущество. Священник перешёл в Ильинскую церковь села Сандыри на окраине Коломны, но и этот храм закрыли. Летом 1938 года он стал служить в Троицком храме в селе Троицком Истринского района. Жить там было негде: жена с дочерью остались в Сандырях, а сам отец Сергий поселился в сторожке, устроенной под храмом.

Весной 1940 года на него донесли осведомители. По их словам, священник рассказывал, как при изъятии имущества у него забрали буквально всё и выгнали из дома, и говорил, что людей угоняют и мучают, а массовые репрессии озлобляют народ, — прибавляя при этом евангельские слова о том, что взявшие меч от меча и погибнут. Один из доносчиков пришёл к нему с бутылкой крепкого вина, надеясь разговорить священника о политике, но отец Сергий пить отказался и на политические темы говорить не стал, так что гость выпил всё сам.

Все обвинения священник отверг. Он заявил, что никогда не клеветал на руководителей государства и относится к власти так, как учит Писание: властям следует повиноваться, ибо нет власти не от Бога. Доказательств вины у следствия не было, но 28 сентября 1940 года Особое совещание при НКВД приговорило его к восьми годам лагерей, и 5 октября он был отправлен в Ивдельлаг. Священник Сергий Кочуров скончался 12 декабря 1941 года в лагере и был погребён в безвестной могиле.