Преподобный Арсений родился в Новгороде Великом и был ремесленником — работал по меди. В 1373 году он поступил в новгородский Лисицкий монастырь и принял там постриг с именем Арсений.

Одиннадцать лет он прожил в обители, проходя разные послушания, а потом ушёл на Афон. В одном из афонских монастырей он провёл три года: делал для тамошних иноков медную посуду и много времени отдавал молитве. Когда пришла пора возвращаться на Русь, игумен Иоанн благословил его иконой Пресвятой Богородицы — впоследствии она стала известна как Коневская — и передал общежительный устав.

Дальше подвижник жил на Валааме и часто молил Господа указать место для новой обители. Однажды, находясь в море, он попал в бурю, и она принесла его к острову Коневец на Ладожском озере. Арсений понял это как Божий промысл: поставил крест, остался на острове и в 1393 году построил часовню. Пять лет он подвизался здесь как в скиту, а в 1398 году по благословению новгородского архиепископа Иоанна преобразовал скит в общежительный монастырь и возвёл храм в честь Рождества Пресвятой Богородицы.

Позже, при архиепископе Симеоне, он снова ходил на Афон — просить молитв и благословения для своей обители. Оставшаяся без игумена братия терпела лишения и подумывала разойтись. Живший неподалёку старец Иоанн постоянно молился о них на вершине острова, и Матерь Божия явилась ему во сне с утешением: пусть скорбящие братья знают, что Арсений скоро привезёт им всё нужное. Так и вышло — преподобный вернулся с припасами. В 1421 году, после разлива Ладоги, обитель пришлось перенести на другое место того же острова, и под руководством Арсения она снова расцвела. Новгородские владыки помогали инокам; особенно усердствовал святитель Евфимий II, который в 1446 году посетил монастырь, щедро пожертвовал ему и подарил преподобному свой клобук. 12 июня 1447 года святой Арсений скончался на руках любящей братии и был погребён в монастырском храме.

Преподобного почитают как покровителя моряков. Известен случай, когда он спас старца Моисея с рыбаками: застигнутые бурей, они молились Господу, и явившийся святой осенил их мантией — лодка благополучно пристала к берегу. Житие Арсения написал в XVI веке коневский игумен Варлаам, а в 1850 году его издали вместе со службой и похвальным словом.

Пишут преподобного в монашеском одеянии, часто с Коневской иконой Богородицы в руках или с видом островной обители за спиной. Такой образ нередко берут с собой те, кто ходит по воде или часто бывает в дороге.