Преподобный Никифор родился в Важеском погосте близ реки Свири, в крестьянской семье, где его с детства учили страху Божию. О детстве и юности житие ничего не сообщает. Известно, что в Свирскую обитель он пришёл около 1510 года уже иноком, и преподобный Александр Свирский принял его в братию, зная о его подвижнической жизни и о тяжёлых веригах, которые тот носил на теле.

Несколько лет Никифор прожил в Свирском монастыре. За это время он совершил два дальних путешествия. Первое — по поручению наставника: Александр послал его к новоезерскому подвижнику Кириллу за благословением и молитвами, а заодно поучиться монастырскому уставу. Житие рассказывает, что преподобный Кирилл, окончив вечернее правило, сам сел в лодку и переплыл озеро туда, где путник заснул на берегу. У него Никифор пробыл восемь дней. Второе путешествие он выбрал сам — пошёл в Киев поклониться Печерским угодникам. Александр отпускал его со слезами и просил остаться, но Никифор ответил, что разлучаются они телом, а духом останутся вместе.

Из Киева преподобный вернулся с намерением устроить собственную обитель. Обходя родные места, он остановился там, где незадолго до того окончил жизнь преподобный Геннадий, — на Важеозере, в двенадцати верстах от Свирского монастыря. Здесь он поставил монастырь с храмом в честь Преображения Господня; обитель эту называют Задненикифоровской пустынью. Геннадий держался строгого затвора, Никифор же был сторонником общежительного устава — и собрал вокруг себя братию. Много лет ушло на устройство: он расчистил место от леса, осушил болото, построил десять келлий и выхлопотал царскую грамоту на окрестную землю. Скончался преподобный 9 февраля 1557 года.

В начале XVII века Олонецкий край разорили иноземцы: обитель разграбили, иноков разогнали. Но память о преподобных Геннадии и Никифоре не исчезла. Над их общей могилой поставили часовню, потом понемногу возродился и монастырь: в 1846 году он получил самостоятельность, а в 1858-м над мощами освятили храм во имя Всех святых.

Преподобных принято писать в монашеском одеянии, со свитком в руке; основателям обителей нередко изображают и модель монастыря — так иконописец показывает, чем святой послужил Церкви. Память преподобного Никифора Важеозерского совершается 22 февраля и 3 июня.