Священномученик Михаил родился 15 сентября 1867 года в деревне Шор-Касы Курмышского уезда Симбирской губернии — ныне это Шумерлинский район Чувашии — в крестьянской семье. Он окончил начальное народное училище, затем Симбирскую духовную семинарию и в тот же 1892 год был рукоположен во диакона к селу Туваны, а через два года — во священника к селу Раскильдино.

Служил он в основном в двух чувашских сёлах, Раскильдине и Красных Четаях, и много занимался школами: заведовал второклассной учительской школой, был помощником благочинного, депутатом от духовенства на окружных и епархиальных съездах, а с 1914 года — постоянным следователем от духовного ведомства по уезду. Награды шли одна за другой: набедренник, скуфья, камилавка, золотой наперсный крест, в 1923 году сан протоиерея, в 1925-м палица. В 1924–1929 годах он был благочинным округа, в 1936-м его снова назначили благочинным, теперь Аликовского района.

Спокойными эти годы не были. В 1925 году храм в Раскильдине на время захватывали обновленцы. В 1929 году отец Михаил по прошению вышел за штат, но уже через год епископ Алатырский Митрофан благословил его вернуться на приход и не оставлять верующих без богослужения.

10 декабря 1937 года священника арестовали. На допросах следователь спрашивал, вёл ли он агитацию против колхозов и выборов, давал ли указания председателю церковного совета; отец Михаил отвечал, что виновным себя не признаёт, и подробно объяснял, как было дело. 14 марта 1938 года на закрытом заседании в городе Шумерля его и ещё троих односельчан признали виновными и приговорили к десяти годам исправительно-трудового лагеря.

Отбывать срок его отправили в Алатырскую исправительно-трудовую колонию, где в те же годы находились и другие священнослужители. Отец Михаил, несмотря на преклонный возраст, продержался в колонии почти четыре года. Не выдержав суровой зимы и постоянного недоедания, он скончался 28 января 1942 года; похоронили его в безвестной могиле на кладбище колонии. Определением Священного Синода от 27 декабря 2007 года протоиерей Михаил Самсонов причислен к лику новомучеников.

Храм в Раскильдине, где он служил, после его ареста стоял на замке, в войну был обращён в зернохранилище, а в апреле 1945 года открылся снова и действует поныне.