Михаил Фёдорович Рыбин родился 26 октября 1877 года в подмосковном селе Молоди, в крестьянской семье. Окончив сельскую школу, он остался при земле, а потом освоил ремесло гравёра и занимался чеканкой окладов для икон — работа тонкая и церковная, хотя ещё не служение.

Он рано овдовел и один поднимал двоих детей — сына и дочь. Когда они выросли, Михаил Фёдорович выбрал другую жизнь: с 1919 года стал псаломщиком, затем диаконом, а в 1925 году был рукоположен во священника — к храму Воскресения Словущего в родном селе. За усердие его наградили наперсным крестом.

В январе 1938 года следователи собрали в Молодях показания должностных лиц. Председатель сельсовета рассказал, что священник, приходя выяснять налоги, при колхозниках жаловался на притеснение духовенства. Председатель колхоза объяснил неурожай 1936 года иначе: будто отец Михаил распустил слух, что без молебна всё погибнет, и часть колхозников не вышла на работу. Свидетели упомянули и то, что он крестил подростков по просьбе матерей, без ведома отцов.

Арестовали его 25 января 1938 года и отвезли в серпуховскую тюрьму. Уже при заполнении анкеты он повёл себя так, как ведёт себя человек, понимающий, что каждый его ответ может стоить свободы другому: сказал, что одинок, связей ни с кем не имеет и точных адресов не знает.

Допрашивали его один раз, в день ареста. На вопрос о знакомых священниках он назвал нескольких — и тут же добавил, что все они уже арестованы. Обвинение в антисоветской агитации он отверг: да, признал он, прихожане приходили к нему советоваться, идти ли в колхоз или на производство, жаловались на дороговизну и необеспеченность, и он с ними об этом говорил, — но против власти он никогда ничего не говорил и вины за собой не видит.

Следствие закончили в тот же день. 2 февраля тройка НКВД приговорила священника к расстрелу. Его перевели в Таганскую тюрьму в Москве, где 8 февраля сняли фотографию для палача. Приговорённых было столько, что исполнения он ждал ещё неделю; тогда никому не объявляли приговор заранее, зачитывая его только перед казнью.

Священника Михаила Рыбина расстреляли 17 февраля 1938 года и погребли в безвестной общей могиле на полигоне Бутово под Москвой.