Преподобный Исидор жил на рубеже IV и V веков. Родом он из Александрии, вырос в благочестивой христианской семье и был в родстве с Феофилом, архиепископом Александрийским, а также с его преемником — святым Кириллом.

Ещё юношей Исидор оставил мир и ушёл в Египет, на Пелусиотскую гору: от неё и пошло его прозвание. Там он и подвизался. Строгая жизнь соединялась в нём с широкой образованностью и редким пониманием человеческой души — иноки быстро прониклись к нему уважением, избрали своим настоятелем и упросили принять сан пресвитера.

Во время поездки в Константинополь Исидору довелось видеть и слышать святителя Иоанна Златоуста, и это определило всю его дальнейшую жизнь. Главным своим делом он выбрал проповедь — ту самую «практическую философию», которую сам называл и основанием здания, и самим зданием, тогда как логика для него была лишь украшением постройки, а созерцание — её венцом. За советом к нему шли все подряд: простые люди, вельможи, епископы, патриарх Александрийский и даже император.

После преподобного осталось около десяти тысяч писем, из которых до нас дошло 2090. Большей частью это толкования Священного Писания — глубокие богословски и очень практичные нравственно. Именно здесь видно, насколько внимательным учеником Златоуста он был.

Верность учителю Исидор доказал делом. Он решительно вступился за святителя Иоанна во время гонения на него со стороны императрицы Евдоксии и архиепископа Феофила, а после кончины Златоуста убедил святого Кирилла Александрийского внести его имя в церковные диптихи как имя исповедника. По настоянию преподобного был созван III Вселенский Собор в Ефесе (431 год), осудивший учение Нестория о Лице Иисуса Христа.

Скончался преподобный в глубокой старости, около 436 года. Церковный историк Евагрий писал, что жизнь его казалась современникам ангельской, а Никифор Каллист называл святого живым столпом иноческих уставов. На иконах преподобных принято писать в монашеских одеждах, со свитком в руке — знаком учительного слова.