Будущий священномученик появился на свет 2 июня 1869 года. Родиной его было село Захарово Клинского уезда Московской губернии, отцом — диакон Василий Парусников. Окончив в 1890 году Московскую духовную семинарию, он несколько лет учительствовал в церковноприходских школах, а 2 марта 1892 года был рукоположен во священника. С этого дня и до самого ареста он служил на приходах Московской епархии. Церковные награды шли своим чередом: наперсный крест, сан протоиерея, крест с украшениями, митра.

В 1934 году его назначили настоятелем Успенского храма в селе Успенском Ногинского района. Храм этот стоял с 1756 года; за полтора столетия прихожане богато его украсили и собрали дорогую ризницу. В январе 1930 года церковь закрыли и обратили в клуб, а ризницу разграбили; летом того же года храм вернули общине — многое пропало безвозвратно, но всё нужное для службы нашлось.

Потом отца Иоанна перевели в церковь Рождества Богородицы села Нестерово Орехово-Зуевского района, и там его ждала беда особого рода. Грабители унесли из храма ризы с икон и дароносицу. По советским законам всё, что находилось в церкви, включая богослужебные предметы, считалось государственным имуществом, — и власти под угрозой уголовного дела потребовали от священника возместить стоимость украденного. Денег у общины не было, пришлось просить отсрочку.

Осенью 1937 года сотрудники НКВД допросили двух дежурных свидетелей — председателя местного колхоза и комсомольца, которые подписали то, что от них требовалось. 10 февраля 1938 года священника арестовали и посадили в Таганскую тюрьму в Москве. На допросе он всё отрицал: агитации среди колхозников не вёл; да, люди при нём выражали недовольство властью — и на улице, и когда везли его куда-нибудь на лошади, и на поминках, но сам он ничего подобного не говорил. Следствие закончили 17 февраля, а 19-го тройка НКВД приговорила его к расстрелу. Протоиерея Иоанна Парусникова расстреляли 7 марта 1938 года и погребли в общей безвестной могиле на полигоне Бутово под Москвой.

Священномучеников принято писать в иерейском облачении, с крестом в руке; узнают образ по надписанию имени. К отцу Иоанну обращаются, прося спокойствия и ясной головы перед неправым судом.