Священномученик Феодор родился 17 апреля 1865 года в селе Усть-Кера (Аршиновка) Пензенской губернии, в семье диакона Стефана Каллистова. По сохранившимся метрикам, предки его по мужской линии служили в церкви ещё с петровских времён.

В 1880 году он окончил духовное училище, в 1886 году — Пензенскую духовную семинарию и был определён псаломщиком в родное село. В октябре 1887 года он женился на Антонине Константиновне Вазерской, дочери известного в губернии законоучителя и деятеля церковноприходских школ; семьи дружили, и молодые знали друг друга с детства. В том же году Феодора Стефановича рукоположили во священника.

Дальше были тридцать лет служения по сёлам Пензенской губернии и постоянная работа законоучителем в церковноприходских и земских школах и училищах. Его благодарили за успехи по Закону Божию, наградили камилавкой, а в 1914 году — орденом святой Анны третьей степени за усердное преподавание. В семье родилось четырнадцать детей; четверо умерли в малолетстве, десятеро выросли. Учительский дар передался и им: почти все дочери, пережившие войну, работали учительницами, а один из сыновей стал учителем математики и директором школы.

В 1916 году отца Феодора перевели в соборную церковь города Троицка Краснослободского уезда. Там его настигло горе: в декабре того же года умерла дочь Екатерина, а через два года — жена. В 1922 году настоятеля собора возвели в сан протоиерея.

Последние годы были сплошными скорбями. 28 февраля 1930 года его задержали сотрудники ОГПУ; обвиняли, среди прочего, в том, что он «заставлял верующих принимать причастие». Прихожане просили отпустить священника под их поручительство, но осенью его выслали на три года в Западную Сибирь — ему шёл шестьдесят шестой год. Троицкий храм закрыли.

В 1933 году он вернулся и сумел открыть церковь заново, хотя в округе были закрыты почти все храмы. Работающий храм властям мешал, и доносы шли лавиной. В 1935 году церковь закрыли за неуплату налога за здание; отец Феодор снова добился её открытия и стал собирать деньги на налог, чтобы это не повторилось.

14 августа 1937 года его арестовали. На следствии он держался мужественно, никого не обвинял, имён не называл, обвинений не признал. 22–23 августа тройка НКВД постановила его расстрелять. Приговор привели в исполнение 3 сентября 1937 года.

В октябре 2019 года Священный Синод включил имя протоиерея Феодора Каллистова в Собор новомучеников и исповедников Церкви Русской и определил совершать его память в день мученической кончины.

Священномучеников принято писать в облачении, с крестом в руке; узнают образ по надписанию имени. Молятся отцу Феодору о крепости веры, о большой семье и об учителях.