Будущая преподобномученица родилась 4 декабря 1892 года в крестьянской семье Михаила Черкасова — в селе Кашино, что в Волоколамском уезде Московской губернии. Образование она получила в церковноприходской школе, а в 1915 году поступила в Свято-Троицкий Александро-Невский монастырь неподалёку от деревни Акатово в Клинском уезде. Обитель была молодой: сначала, в 1890 году, здесь возникла община, а монастырём её зарегистрировали в 1898-м. К тому времени в ней было два храма и около ста сестёр.

Послушница Екатерина подвизалась в монастыре до 1922 года. Когда начались гонения, ей пришлось уйти; она поселилась в селе Мокруша Истринского района, где жили многие сёстры разорённой обители. Монастыря не стало, но жизнь их осталась почти уставной: те же правила, то же единомыслие, та же надежда на спасение. Рассыпанные по миру, эти монахини и послушницы для многих оказались опорой — кого-то укрепили в вере, кого-то привели ко Христу.

В декабре 1937 года с помощью лжесвидетелей оформили нужные показания, и начальник районного отделения НКВД в Истре выписал справку на арест. В ней говорилось, что послушница ведёт среди населения контрреволюционную работу и высказывает пораженческие настроения. Её взяли в ночь на 20 января 1938 года, сразу после праздника Богоявления, и заключили в камеру при отделении НКВД.

Допросы начались немедленно и шли непрерывно. Следователи сменяли друг друга — один, второй, третий, четвёртый, пятый; каждый начинал сначала, зачитывал показания лжесвидетелей и требовал признания. Екатерина подтверждала только то, что было правдой: до 1922 года жила в Акатовском монастыре, была лишена права голоса вплоть до 1936 года, веры своей не скрывает. Всё остальное — слухи о войне, разговоры о расстрелянных, антисоветская агитация — она отвергала спокойно и одинаково: этого не было, виновной себя не признаёт.

После Истры её перевезли в Бутырскую тюрьму. Тройка НКВД вынесла смертный приговор 26 января 1938 года. 4 февраля тюремный фотограф снял её для палача, и в ту же ночь послушницу отвезли на полигон Бутово. Расстреляли её 5 февраля 1938 года и погребли в общей безвестной могиле.