Преподобномученица Афанасия — в миру Александра Васильевна Лепёшкина — родилась в 1885 году в Москве, в семье богатых московских купцов. Несколько поколений Лепёшкиных были известны щедрой благотворительностью, особенно на строительство и возобновление храмов.

В 1902 году, окончив Усачевско-Чернявское женское училище, семнадцатилетняя Александра стала послушницей Троице-Одигитриевского монастыря Зосимова пустынь, что в Верейском уезде Московской губернии. Обитель эта была близка её семье: её прадед строил и содержал монастырь, и благодаря его трудам в 1856 году пустынь утвердилась как монастырь. Полгода послушница училась иконописи в Серафимо-Понетаевском монастыре, а после 1914 года была пострижена в рясофор с именем Афанасия.

После 1917 года монастырь закрыли, но сёстры сумели устроиться как сельскохозяйственная артель «Зосимова пустынь» и продержались до 1928 года. Председателем артели стала мать Афанасия: в 1920 году её постригли в мантию, и сёстры избрали её игуменией. Артель кормила двести сестёр, и весь тяжёлый труд организатора лёг на её плечи. Всё это время в монастыре, существовавшем фактически нелегально, не прерывалась церковная служба.

В 1928 году артель разгромили. Матушка с послушницей Евдокией Бучинёвой поселилась в селе Петровское под Наро-Фоминском, рядом с Алабинской больницей: она была уже тяжело больна туберкулёзом и пороком сердца. Жили своим трудом — стегали одеяла.

В мае 1931 года игумению арестовали и по обвинению в антисоветской агитации выслали на пять лет в Казахстан. В протоколе допроса остались её слова: в монастыре она была крепко предана Богу, такой же осталась и теперь, и готова положить жизнь за Христа. На второй день после прибытия на место ссылки она скончалась, а на следующий день умерла и её верная послушница Дуня; похоронили их в одной могиле. Случилось это летом 1931 года.

В августе 2000 года Юбилейный Архиерейский Собор причислил преподобномученицу Афанасию к лику новомучеников и исповедников Российских для общецерковного почитания.