Преподобный Никон родился в Юрьеве-Польском. Ещё юношей он услышал о том, как живёт преподобный Сергий Радонежский, захотел жить так же и пришёл к нему проситься в монахи.

Сергий принял его не сразу. Провидя в юноше будущего большого подвижника и желая проверить его терпение и смирение, он отправил его к другому своему ученику — преподобному Афанасию Высоцкому. Там Никон и получил школу: учился внутренней, умной молитве, изучал Священное Писание, возрастал в добродетели и чистоте. Уже приняв сан иеромонаха, он вернулся в Троицкую обитель и стал самым близким и любимым учеником преподобного Сергия. Тот перед кончиной сам назначил его своим преемником — потому что видел его духовную зрелость и опыт.

Игуменом преподобный Никон оказался таким, что при нём в обители ничего не сломалось: он держался всего, что было заведено учителем. Любил молитву и пост, работал наравне с братией и постоянно о ней заботился. При нём же, 5 июля 1422 года, когда в обители строили новый храм во имя Живоначальной Троицы, были обретены нетленные мощи учителя.

Преподобный Никон скончался 17 ноября 1426 года и был погребён рядом с ракой своего учителя. В 1548 году над его гробницей возвели первый каменный Никоновский храм (нынешнее здание построено в 1623 году). Мощи преподобного Никона почивают там под гробницей, и от раки преподобного Сергия их отделяет всего одна каменная стена — так они и остались рядом, как при жизни.

Преподобных на иконах принято писать в монашеском облачении — мантии, куколе или клобуке, часто со свитком в руке. Основателей и игуменов обителей нередко изображают с моделью монастыря; преподобного Никона обычно пишут вместе с преподобным Сергием или рядом с его образом.