Святитель Геннадий, архиепископ Новгородский, происходил из рода Гонзовых; современники называли его мужем сановитым, умным, добродетельным и сведущим в Священном Писании. Первое монашеское послушание он проходил на Валааме под руководством преподобного Савватия Соловецкого, затем стал архимандритом Чудова монастыря в Москве, а 12 декабря 1484 года был посвящён в архиепископа Новгородского.

Его святительство пришлось на трудное для Русской Церкви время. Ещё с 1470 года в Новгороде тайно распространялось лжеучение, которое сеяли приезжие проповедники, выдававшие себя за торговых людей. О ереси владыка узнал в 1487 году — случайно: несколько её участников, поссорившись во хмелю, сами выдали друг друга. Архиепископ немедленно начал розыск и с горечью убедился, что опасность грозит не только Новгороду, но и Москве, куда ещё в 1480 году переехали вожди еретиков. В сентябре того же года он отправил митрополиту всё розыскное дело вместе со списком отступников и их писаниями. Борьба продолжалась девятнадцать лет — вместе с преподобным Иосифом Волоцким, который писал, что архиепископ устремился на еретиков, как лев, из чащи Божественных Писаний.

Из этой борьбы вырос главный труд святителя. Еретики опирались на искажённые тексты ветхозаветных книг, а на Руси, по византийскому обычаю, библейские книги переписывали не целым сводом, а по частям, и искажения в них были делом обычным. Архиепископ Геннадий собрал вокруг себя учёных книжников, разыскал исправные списки, а те книги, которых не нашлось в славянском рукописном предании, благословил заново перевести с латинского. В 1499 году вышел первый полный свод Священного Писания на славянском языке — его так и называют Геннадиевской Библией. Через неё, а затем через Острожскую Библию 1581 года славянский библейский текст дошёл до Елизаветинской Библии и всех позднейших изданий.

Был и второй громкий труд. К концу XV века над умами тяготело ожидание конца света: пасхалия была рассчитана только до 1491 года, и продолжать её не решались. Собор 1491 года постановил написать пасхалию на восьмую тысячу лет, и святитель Геннадий составил свою — сразу на семьдесят лет вперёд, с толкованием и окружной грамотой. В этом толковании он писал, что бояться нужно не конца мира, а ждать пришествия Христова во всякое время, и что сроков не знает никто, кроме Отца. Позднее, в 1539 году, по утверждённым им правилам была рассчитана пасхалия на всю восьмую тысячу лет.

При архиепископе шла и другая работа: составили Четвёртую Новгородскую летопись, переводили и переписывали книги, собирали библиотеку для Соловецкого монастыря — более двадцати переписанных с его благословения книг сохранились в соловецком собрании. Ради подготовки достойного духовенства святитель основал в Новгороде школу. Ему принадлежат послания митрополитам и епископам, церковный «Уставец», «Предание инокам» и молитва к Пресвятой Богородице, составленная в 1497 году.

Оставив кафедру, последние годы святитель провёл на покое в Чудовом монастыре и мирно отошёл ко Господу 4 декабря 1505 года. Мощи его положили в том самом месте, где прежде покоились мощи особо чтимого им святителя Алексия, митрополита Московского. Память святителя Геннадия совершается и в третью Неделю по Пятидесятнице, когда Церковь вспоминает всех новгородских святых.