Аполлинария была дочерью Анфемия — человека, который правил Греческой империей, пока Феодосий Младший был мал. От замужества она отказалась и упросила родителей отпустить её поклониться святыням Востока.

Из Иерусалима она приехала в Александрию — и там тайком от собственных слуг переоделась в иноческую одежду и скрылась. Несколько лет она провела в болотистом месте, в строгом посте и молитве. Потом, по откровению свыше, пришла в скит к преподобному Макарию Египетскому и назвалась иноком Дорофеем. Макарий принял её в число братии, и вскоре о новом иноке пошла слава как о настоящем подвижнике.

У её родителей была вторая дочь, которая страдала беснованием. Больную отпустили в скит к преподобному Макарию, и тот привёл её к иноку Дорофею; по молитве святой девушка исцелилась. Дома, однако, всё повторилось: диавол придал ей вид беременной. Родители в гневе послали в скит воинов — требовать выдачи виновника.

Аполлинария взяла вину на себя и пошла с посланными в родительский дом. Там она открыла отцу и матери, кто она, исцелила сестру и вернулась в скит, где вскоре мирно скончалась в 470 году. Что инок Дорофей был женщиной, узнали только после её смерти. Погребли святую в пещере, в церкви обители преподобного Макария Египетского.