О преподобном Иродионе известно немного: ни года рождения, ни родителей, ни звания. Житие начинается с того, что он был учеником преподобного Корнилия Комельского.

После кончины наставника в обители начались нестроения: одни добивались начальственных должностей и заботились о собственном покое, другие, храня в памяти образ учителя, предпочли жизнь трудную и уединённую и разошлись кто на восток, кто на север. Среди этих вторых был и Иродион. Он пришёл к Белоозеру, к селению Илоское, поставил себе часовню и небольшую келью и в строгом уединении прожил там немного лет, но потрудился много.

Однажды ночью, задремав после долгого бдения, он услышал: «Встань, старец!» — и Ангел указал ему идти на остров озера Иле и поставить там церковь в честь Рождества Пресвятой Богородицы. Преподобный проснулся в трепете, помолился и отправился в путь. По дороге, у реки, он во сне услышал звон на пустынном полуострове, вдававшемся в озеро, — так место было указано вторично. Земля принадлежала христолюбивому человеку по имени Анисим; преподобный купил её и построил церковь, украсив её иконами и утварью, а сам поселился в церковной трапезе.

Уединения хватило ненадолго. Прослышав о подвижнике, окрестные жители потянулись к нему за наставлением и приносили пищу — он раздавал её нищим, а сам ел ровно столько, чтобы не умереть от голода. Однажды пришедший к нему благочестивый Елисей трижды сотворил молитву у дверей и, не получив ответа, вошёл — и увидел преподобного лежащим на горящих углях в печи. Тот вышел из печи невредимым и попросил гостя простить его, а рассказывать о виденном строго запретил.

Постепенно у построенной церкви стали хоронить умерших, крестить младенцев, венчать. Крестьяне приходили толпами, приносили с собой угощение и хмельное, шумели и ссорились, оглашая тихий берег бранью. Преподобный тяготился этим и молил Господа вернуть его пустыне прежнее безмолвие. Приношения он принимал неохотно, лишь бы не обидеть, и всё раздавал нищим, а подвиги свои усиливал: ночи проводил без сна в молитве, изнурял тело воздержанием, каждую субботу причащался Святых Христовых Таин.

О близкой кончине его известил Ангел. Живший вместе с ним священноинок Исаия причастил старца, и на следующую ночь преподобный отошёл ко Господу. Утром Исаия нашёл его бездыханным, облечённым в схиму, с крестообразно сложенными на груди руками, а келья была полна благоухания. Погребли святого в часовне у построенной им церкви. Случилось это 28 сентября 1541 года, всего через три года после того, как он оставил Комельскую обитель.

Позже над гробом поставили церковь, собралась братия и устроилась обитель. У гроба стали совершаться чудеса: прозревали слепые, начинали ходить хромые, обретали речь немые. Некто Софония по простоте ткнул посохом в могилу преподобного и тотчас ослеп; поняв, за что наказан, он долго плакал и каялся, а во сне святой велел ему снова прийти ко гробу — там он получит прощение. У гробницы Софония прозрел и в благодарность заказал написать образ преподобного таким, каким видел его в видении: это и была первая икона святого. Иконописец Вассиан, тонувший на Илозере в бурю, призвал преподобного и вдруг оказался стоящим на берегу; священник Евфимий, провалившийся под лёд, был словно поднят на руках и перенесён в безопасное место.

Краткое житие преподобного написал архимандрит Белозерского монастыря Митрофан, который в 1653 году по благословению Новгородского митрополита Никона освидетельствовал чудеса от мощей, — тогда и установили празднование памяти святого. На месте часовни воздвигли храм Рождества Пресвятой Богородицы, а придел в нём освятили во имя самого преподобного Иродиона.